· La procesión marítima: Se celebra el día 7 de septiembre y constituye un gran espectáculo ver toa la flota pesquera (es Santoña el principal puerto pesquero de Cantabria) navegando en procesión por aguas de la Bahía siguiendo al buque insignia, que lleva la imagen de la Virgen de Puerto.

· Corrida de Toros: Se desarrolla el día 8 de septiembre y se intenta traer a los toreros mas destacados en esa temporada, dependiendo un poco del programa de los matadores; se suele prestar especial atención al torero del municipio Francisco Marco.

· La Gran Marmitada: Es la fiesta astronómica principal. Se prepara el plato típico llamado marmite a base de bonito y patatas y reparte gratuitamente junto al pan y al vino, se desarrolla en la zona del pasaje en cantidades que superan las ocho mil raciones.

· Regatas: Aunque hay competiciones de remo de diversas modalidades (hay escuela de remo), tanto en banco fijo como en móvil, las regatas de traineras de la liga provincial y otros campeonatos a lo largo de la temporada, se celebra en fiestas una gran regata de traineras en la que se disputa la "Bandera de Santoña", asistiendo a competir en ella embarcaciones de otras comunidades autónomas del Cantábrico.